近年来,随着测序技术和群体研究的进展,加上大型生物样本库的建立,疾病相关变异的检测与解释得到了完善。
然而,许多遗传病患者仍难以确定其致病变异,影响了治疗选择、临床试验参与和家庭规划。
基因治疗的兴起使得寻找准确诊断更加关键,但由于生物数据库中非欧洲裔个体数据的不足,疑义变异的鉴定仍然存在困难。
深度突变筛选,能够通过高通量功能测定生成对突变的功能评分。然而,深度突变筛选的高成本和复杂性限制了其广泛应用。
已建立的饱和诱变方法如程序性等位基因系列(PALS)虽成本低,但是操作烦琐。
此外,功能测定方法如生长富集方法和流式细胞方法也面临成本和准确性挑战。因此,优化深度突变筛选技术对于更好地理解与疾病相关的基因变异至关重要。
为了实现了无需专用试剂、设备或烦琐步骤的饱和诱变,来自美国耶鲁医学院的团队基于程序性等位基因系列的核心概念进行了改进,开发出一种名为程序性等位基因系列一通用流程的方法。
实现深度突变筛选在罕见遗传病中的新突破
耶鲁医学院的马凯玥博士是本次成果的主要研究人员。2019年初,他刚结束博士一年级的三轮轮转,面临选择实验室的抉择。
其中,一个是他熟悉的基因组学方向,课题也与他的兴趣契合;另一个是本次论文共同通讯作者耶鲁医学院蒙科尔·莱克教授的实验室,研究方向是他不太熟悉的罕见遗传疾病的诊断与治疗。
在做出决定前,后者对他说:“我家有3只令人喜受的宠物狗,而吉姆(另一个课题组的负责教授)家只有一只。”正是这句轻松的话语让他做出了最终的选择。
尽管当时他对罕见病研究的挑战和机遇还不够了解,但综合多方因素后,最终正式加入了该团队。
事实上,蒙科尔本人是一名肢带型肌营养不良症患者(由肌联蛋白帽基因TCAP变异引起)。正因为自身的经历,蒙科尔非常关注诊断的速度和准确性,同时致力于开发新的治疗方法。
确定致病基因和致病突变是患者接受基因特异性疗法或参与临床试验的前提条件。然而,对于罕见病患者,获得准确诊断通常需要漫长的时间。
据统计,罕见病患者在发达国家平均需三到四年才能确诊。




